蒙医用药范围很广，包括植物、动物、矿物及化学制品，但绝大部分还是取自野生植物。近40年来，自治区组织过对蒙药植物的物种及分类、地理分布、生态环境、蕴藏量、传统用药经验等诸多方面进行了深入调查，对采集的大量蒙药植物标本整理鉴定，确定蒙药植物品种945种，其中中蒙医兼用药材732种，蒙医专用药材87种，动物药与矿物药250种，总共达1195种。这些植物大多生存在对生物来说是极端的环境（如高寒、干旱）中，而在极端环境下的植物通常会以代谢途径产生一些特殊的物质，增强自身对恶劣环境的抵抗力，保持物种的延续。
   据统计分析，这些生存在极端环境中的药用植物多具有滋补强壮、活血通络、增强机体耐缺氧、抗疲劳、抗衰老能力，由于游牧民族的特点和极端环境中植物的独特功能，蒙药在悠久的历史中形成了一些与其他民族植物药不同的特点，具有蒙古高原的气息和特色。例如：中医药理论认为红花具有活血化瘀、通经破血的功效。而蒙医药理论认为红花有清热解毒、凉血清心的作用。特别是蒙古高原生长的独特蒙药材，在治疗非传染性疾病如：心脑血管系统、呼吸系统与消化系统的各种慢性疾病，自身免疫性疾病和老年病、癌症等常见病，疑难病方面疗效显著，毒副作用小，费用低。